在莫斯科聚集的华约其他成员国首脑始终坚持成立工农革命政府，并强硬地建议如有必要可以实施一定期限的军事占领。在25日的苏联共产党政治局会议上，对于勃列日涅夫和柯西金所采取的解决事态的方案也有人表示异议。经过4天的会谈，26日，两个领导层签署了《莫斯科议定书》，其内容有15项，再次确认了控制媒体、更换改革派的切尔纳会谈的“共识”事项，同时明确宣布22日临时召开的全党大会的无效。此外，对于干预军队的撤退问题，并没有明确撤军的时间。
当捷方代表团中仍有人不愿在包含上述内容的议定书上签字时，波诺马廖夫发出最后通牒：如果不接受苏方提出的条款，他们就别想回国。异国他乡的饭不好吃，尤其是牢饭，所有的人都低下了头。
这次事件之后，西方社会将苏联此次为武装介入辩护的理论称为“限制主权论”或“勃列日涅夫主义”。这个理论认为：社会主义国家的主权在某种情况下是有限的，为了所谓的共同利益和保卫一个国家的社会主义成果，国际法意义上的主权不应视为其他社会主义国家对一个社会主义国家采取任何方式行动的障碍。